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imagej进行蛋白定量

自我介绍 时间:2020-04-06

【www.myl5520.com--自我介绍】

Image J 对Western Blot进行灰度分析
篇一:imagej进行蛋白定量

Image J 对Western blot 条带进行灰度分析

Image J软件:Windows 版本

第一步:软件安装

1. 下载地址:

2. 下载windows 32位带Java版本,双击软件安装。

第二步:界面介绍

1. 软件界面

第三步:图片分析

1.下图为样板图片

2. 导入图片:

File> Open> Sample1.jpg

图片导入后,Sample1.jpg在新的窗口中打开

3. 图片类型设置:

Image> Type> 8 bit

4. 去除图片背景:Process> Subtract Background> „

Subtract Background 窗口:Rolling ball radius 设为50 pixels,勾选light background,可选preview,点击“OK”确定imagej进行蛋白定量。

5. 工具栏:选择“矩形选框”imagej进行蛋白定量。

6. 最大化“Sample1.jpg”窗口,便于矩形选择,矩形选择第一个泳道

7. 标记“矩形选框”为1:矩形选择后,调整矩形至合适大小,按下数字键

“1”,或者Analyze> Gels> Select Fist Lane。

8. 选择“泳道2”:拖动“1”的矩形框,会出现两个矩形选框,拖动矩形框

至泳道2,调整位置,并按下数字键“2”,Image J 会自动调整大小使“矩形框2”与“矩形框1”保持同一水平。

9. 继续拖动,会出项新的“矩形选框”,调增至泳道3,并按下数字键“2”

(注意:是按下数字键“2”),重复9至6个泳道全部选择。

10.所有泳道选择后,按下数字键“3”,出现分析图谱。

11.“直线”封闭峰:工具栏选择“直线”,从起峰处至落峰处。

用ImageJ对Western DNA和Blot图片灰度分析
篇二:imagej进行蛋白定量

用ImageJ对Western Blot图片灰度分析

教程收集于互联网 来源中生网

The good news is that even if you don't have access to a photo editing program such as Photoshop, you can now do all the same analyses using free programs. My favorite option is the freely available ImageJ from the National Institutes of Health.

The homepage for ImageJ is here: wherein you can find links to the download, documentation, additional plugins and so on.

Once ImageJ is installed, open it up and open your scanned film file. We'll start the ImageJ section by duplicating the method outlined above for Photoshop.

1. Open your file.

2. Under Image>Type click on 8-bit to convert the image to grayscale.

3. Go to the menu Process>Subtract Background. Try a rolling ball radius of 50. This removes some of the background coloration from your image.

4. Go to Analyze>Set Measurements, and click the boxes for Area, Mean Gray Value, and Integrated Density.

5. Go to Analyze>Set Scale, and enter "pixels" in the box next to Unit of length.

6. Go to Edit>Invert (or hit Ctrl+Shift+I) to invert the colors on the image. Now the dark areas are light, and the light areas are dark. As outlined above, this has the benefit of making the measured values for bands increase with increasing protein expression.

7. Choose the Freehand Selection tool from the t

ool palette.

8. Draw a line around the boundary of your first band. As above, you need to use your own judgement about

where t

he edges of the band are, and what is simply background noise.

9. Hit the m key to take a measurement of the enclose area that you selected. The Results window should pop up, and each of the measurements you selected in step 4 should appear. Note that the Integrated Density column

is simply the Area and Mean Gray Value columns multiplied together.

10. Use the Freehand Selection tool to select the next band, and press m to take the measurement. Repeat this for each of you bands, including the standard.

11. When you are finished, you can go to the Edit menu in the Results window, and choose Copy All. You can then paste the results into a spreadsheet for later use.

教你使用ImageJ分析电泳条带灰度比-ImageJ使用教程imagej进行蛋白定量。

ImageJ这套软件可以自动帮你你计算细胞数,也可以定量分析DNA电泳或是Western blot条带。

step 1.首先打开软件后,开启图档

step 2.请先做校正,选择Analyze底下的Calibrate选项,再选择校正的模式,使用Uncalibrate OD,再按ok 按下ok之后会出现校正的图形

Step 3.在要分析的第一条(first lane)加上一个长型框(工具列第一个选项),再按下Analyze/Gels/select first Lane快速键(Ctr+1),此时框架中会出现一个号码1,之后可以移动框架到第二个lane再选择Analyze/Gels/select second Lane快速键(Ctr+2),当然可以一直加下去,最后按Analyze/Gels/plot Lanes快速键(Ctr +3)。

Step 4.分析以后会出现图型表示你刚选择的框内的影像强度,此时可以看到有几个比较高的区段,就是我们想定量的band,使用直线工具(工具列第五个选项)先将图形中高点为有band的区域和没有band的区域分开再,使用魔术棒工具(工具列第八个选项)点选要分析的区域。

Step 5.当我们点选分析时,在result的对话视窗会出现分析的数据,依序点选就会出现每个band的值。

Western结果分析-ImageJ
篇三:imagej进行蛋白定量

Western结果分析-ImageJ

1. 打开Image J

2. 在此软件里打开一个扫描后的X胶片

3. 在条带处用矩形框选中

4. 在工具栏依次选择 Analyze → Gels → Select First Lane

5. 移动矩形框至下一条带位置 (Ctrl+鼠标左键)

6. 在工具栏依次选择 Analyze → Gels → Select Next Lane

7. 如果有多条带,继续重复5、6。至此,五条带都被选上(倒数第一个框和倒数第二个框重叠,正常现象)。

imagej进行蛋白定量。

8. 选择完成后,Analyze → Gels → Plot Lane

9. 用魔棒工具依次单击峰区,算出虚线下的面积。

10. Analyze → Gels → Label Peaks

11. Results(Windows-> results)

12. 用实验组除以内参,来正态化数据,再将所得数据在统计软件中进

行分析。

ImageJ分析电泳条带灰度
篇四:imagej进行蛋白定量

教你使用ImageJ分析电泳条带灰度比-ImageJ使用教程

摘要: ImageJ这套软件可以自动帮你你计算细胞数,也可以定量分析DNA电泳或是Western blot条带。 ImageJ这套软件可以自动帮你你计算细胞数,也可以定量分析DNA电泳或是Western blot条带。

step 1.首先打开软件后,开启图档

step 2.请先做校正,选择Analyze底下的Calibrate选项,再选择校正的模式,使用Uncalibrate OD,再按ok

按下ok之后会出现校正的图形

Step 3.在要分析的第一条(first lane)加上一个长型框(工具列第一个选项),再按下Analyze/Gels/select first Lane快速键(Ctr+1),此时框架中会出现一个号码1,之后可以移动框架到第二个lane再选择Analyze/Gels/select second Lane快速键(Ctr+2),当然可以一直加下去,最后按Analyze/Gels/plot Lanes快速键(Ctr +3)。

Step 4.分析以后会出现图型表示你刚选择的框内的影像强度,此时可以看到有几个比较高的区段,就是我们想定量的band,使用直线工具(工具列第五个选项)先将图形中高点为有band的区域和没有band的区域分开再,使用魔术棒工具(工具列第八个选项)点选要分析的区域。

Step 5.当我们点选分析时,在result的对话视窗会出现分析的数据,依序点选就会出现每个band的值。

注:当我们选择分析的条带也可以是横向选取,就可以只比较相同大小的DNA的含量,同样也可以应用在western blot或其它类似实验条带的分析上。

本文来源:http://www.myl5520.com/fanwendaquan/102976.html

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