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origin拟合米氏方程

化学教案 时间:2020-09-24

【www.myl5520.com--化学教案】

米氏常数测定方法
篇一:origin拟合米氏方程

酶活米氏常数实验

一、实验前准备

1、24孔板洗净烘干,准备足够枪头。

2、准备催化剂,在光下呈透明状为分散性较好,否则用超声清洗器(位于化学间)超声分散5min,期间准备底物(如TMB或者ABTS),浓度依照自己实验的要求定(10mg/mL或5mg/mL),一般1mL足够用,可在1.5mL离心管中溶解。TMB(外间冰箱上层)溶于DMSO(二甲亚砜,位于化学间王春雨的柜子里),ABTS(与TMB放在一起)溶于二次水。

3、将缓冲液、催化剂、底物、H2O2、200µL和10µL移液枪、50µL排枪(位于称量处上方模拟酶专用枪的柜中)、96孔板、24孔板、卷纸一起放入纸盒中,放到对面酶标仪前,开空调定室温(25℃,提醒其他人随手关门),24孔板中其中一排加入适量H2O2(每孔1mL左右,注意避光,可在板上盖一张卷纸),将缓冲液、催化剂、底物放实验台上,静置0.5-1h。 4、记录本上提前写好实验的加样顺序:

催化底物TMB(或ABTS)的酶促动力学过程加样顺序:①200µL缓冲液 ②10µL催化剂 ③底物TMB(ABTS)(0,0.5,1,2,4,6,8,10µL) ④32µLH2O2(排枪加) 催化底物H2O2的酶促动力学过程加样顺序:①200µL缓冲液 ②10µL催化剂 ③H2O2(2,4,6,8,10,16,32,64µL) ④10µL底物TMB(ABTS)(排枪加)

数据记录按下表记,Code为每次读板时的微孔板编号,Time为对应的读板时的时间,一般30s读板一次,可根据反应的快慢来确定读板的时间。 Code Time TMB V01

Code Time H2O2 V01 二、实验

1、打开酶标仪(开关在仪器后部,若仪器没反应,请检查电源是否接通),密码为5个

1 2

2 4

3 6

4 8

5 10

6 16

7 32

64

1 0

2 0.5

3 1

4 2

5 4

6 6

7 8

origin拟合米氏方程。

10

0,按Enter键进入系统。电脑开机,密码为mby-nano,双击酶标仪软件图标,出

现登录

框,直接点击“登录”,进入酶标仪控制界面origin拟合米氏方程。

,若底物为TMB,origin拟合米氏方程。

选择“铁动力学”(波长为

650nm)

,选择模

板1

打开电脑内置时

; 钟

若底物为

ABTS,则检验项目选择“gg”(波长为

405nm)

新建一个word文档,以日期命名,打开。

2、加样:96孔板从左至右编号为1-12,自上而下编号为A-H。以TMB为例,从第1列加样:

①从A1至H1,每孔加200µL NaAc/HAc Buf; ②从A1至H1,每孔加10µL催化剂(每加一个孔,换一次枪头,加样时用枪头搅匀反应体系); ③从A1至H1,每孔分别加不同体积(0,0.5,1,2,4,6,8,10µL)TMB(每加一个孔,换一次枪头,加样时用枪头搅匀反应体系);

④用排枪吸取32µL H2O2加入A1至H1,快速放入酶标仪中,点击“读板”,记下读板时间(如下表所示,假设第一次读板时间为09:00:00) Code Time TMB

用排枪加H2O2时,注意检查枪头是否插紧,否则会导致吸取H2O2的量不足。亦可先将96孔板放入酶标仪,再加H2O2,这样可以节约时间。每次读板出来结果后,点击“结果入库”——>“是”——>“确定”,按下“PrintScreen”键,点击“退出”,打开word文档,ctrl+V或者右击选“粘贴”,保存结果,要留意下次读板的时间。若遗漏某个模板没有保存,可点击“查询结果”,下拉框中选择目的模板编号即可。(现已可以直接拷吸光值读取数据,按ctrl键点击该处文字见方法)

3、第一组数据保存后,将第一组的反应液倒掉,用卷纸将边上的液体擦干。第二、三、四组同第一组的操作。保存所有数据,拷贝到U盘里,整理实验台,关掉酶标仪、空调和电脑。

4、若当天不再继续实验,将24孔板中剩余的H2O

2倒掉,用清洁剂洗后,再用二次水冲洗一次,放入烘箱中烘干。移液枪放回原处,催化剂、底物和H2O2放入冰箱中保存。

三、数据处理

1、打开Origin6.1,点击右上角的“Add New Column”(箭头所指):

1 00:00

0 2 00:30 0.5 3 01:00 1 4 01:30 2 5 02:00 4 6 02:30 6 7 03:00 8 03:30 10 ,亦可右击——> Add New Column

2、输入数据:命名各列,X列命名为时间,单位s,8个Y列分别为8个孔的编号。X列时间从0-180s,0 s对应微孔板编号1的数据,30 s对应code2的数据,以此类推,将所读数据输入。origin拟合米氏方程。

点击“file”—>“Save Project As”,

米氏方程概述
篇二:origin拟合米氏方程

米氏方程概述

v=Vmax×[S]/(Km+[S]),

这个方程称为Michaelis-Menten方程,是在假定存在一个稳态反应条件下推导出来的,其中 Km 值称为米氏常数,Vmax是酶被底物饱和时的反应速度,[S]为底物浓度。由此可见Km值的物理意义为反应速度(v)达到1/2Vmax时的底物浓度(即Km=[S]),单位一般为mol/L,只由酶的性质决定,而与酶的浓度无关。可用Km的值鉴别不同的酶。

当底物浓度非常大时,反应速度接近于一个恒定值。在曲线的这个区域,酶几乎被底物饱和,反应相对于底物S是个零级反应。就是说再增加底物对反应速度没有什么影响。反应速度逐渐趋近的恒定值称为最大反应速度Vmax。对于给定酶量的Vmax可以定义为处于饱和底物浓度的起始反应速度n。对于反应曲线的这个假一级反应区的速度方程可写成一种等价形式:

n(饱和时)=Vmax=k[E][S]0=k[E]total=k cat[ES]

速度常数k等于催化常数k cat,k cat是ES转化为游离的E和产物的速度常数。饱和时,所有的E都是以ES存在。方程(3.2)中还有另一个简单的关系式:Vmax=k cat [E]total。从中得出:k cat=Vmax / [E]total。k cat的单位是s-1。催化常数可以衡量一个酶促反应的快慢。

米氏常数Km是酶促反应速度n为最大酶促反应速度值一半时的底物浓度。这可通过用[S]取代米氏方程中的Km证明,通过计算可得n=Vmax /2。

(1)Km和Vmax的意义

① 当ν=Vmax/2时,Km=[S]。因此,Km等于酶促反应速度达最大值一半时的底物浓度。

② 当k-1>>k+2时,Km=k-1/k+1=Ks。因此,Km可以反映酶与底物亲和力的大小,即Km值越小,则酶与底物的亲和力越大;反之,则越小。 ③ Km可用于判断反应级数:

当[S]<0.01Km时,ν=(Vmax/Km)[S],反应为一级反应,即反应速度与底物浓度成正比;

当[S]>100Km时,ν=Vmax,反应为零级反应,即反应速度与底物浓度无关;

当0.01Km<[S]<100Km时,反应处于零级反应和一级反应之间,为混合级反应。

④ Km是酶的特征性常数:在一定条件下,某种酶的Km值是恒定的,因而可以通过测定不同酶(特别是一组同工酶)的Km值,来判断是否为不同的酶。

⑤ Km可用来判断酶的最适底物:当酶有几种不同的底物存在时,Km值最小者,为该酶的最适底物。

⑥ Km可用来确定酶活性测定时所需的底物浓度:

当[S]=10Km时,ν=91%Vmax,为最合适的测定酶活性所需的底物浓度。 ⑦ Vmax可用于酶的转换数的计算:当酶的总浓度和最大速度已知时,可计算出酶的转换数,即单位时间内每个酶分子催化底物转变为产物的分子数。

Km和Vmax的测定:主要采用Lineweaver-BurkHanes作图法。

(2) 双倒数作图

酶促反应中的Km和Vmax值有几种测量方法。

固定反应中的酶浓度,然后分析几种不同底物浓度下的起始速度,就可获得Km和Vmax值。但直接从起始速度对底物浓度的图中确定Km或Vmax值是很困难的,因为曲线接近Vmax时是个渐进过程。

所以通常都是利用米氏方程的转换形式求出Km和Vmax值。

常用的米氏方程转换形式是Lineweaver-Burk方程,也称为双倒数方程。 使1/ v 对1/[S]作图,可以获得一条直线。从直线与x轴的截距可以得到1/Km的绝对值;而1/Vmax是直线与y轴的截距。双倒数作图直观、容易理解,为酶抑制研究提供了易于识别的图形。

(3) 抑制作用的影响 竞争性抑制

Km值增大,Vmax值不变 非竞争性抑制

Km值不变,Vmax值变小 反竞争性抑制

Km值变小,Vmax值变小,但Vmax/Km值不变

米氏方程
篇三:origin拟合米氏方程

米氏方程与双倒数作图法Lineweaver-Burk plot 米氏方程(Michaelis-Menten Equation)或米曼氏动力学(Michaelis-Menten kinetics)是由Leonor Michaelis和Maud Menten在1913年提出,是

酶学

中极为重要的可以描述多种非变异构酶动力学现象、表示一个酶促反应的起始速度V(有些资料中也称为Vo)与底物浓度[S]关系的速度方的方程,米氏方程形式如下:

其中,Vmax表示酶被底物饱和时的反应速度,Km值称为米氏常数,是酶促反应速度V为最大酶促反应速度值一半时的底物浓度。在酶促反应中,底物情况在低浓度下,反应相对于底物是一级反应(first order reaction);而当底物浓度处于中间范围时,反应(相对于底物)是混合级反应(mixed order reaction);当底物浓度增加时,反应由一级反应向零级反应(zero order reaction)过渡;当底物浓度[S]逐渐增大时,速度V相对于[S]的曲线为一双曲线。下图为米氏方程的模拟作图:

酶促反应中的米氏常数的测定和Vmax的测定有多种方法。比如固定反应中的酶浓度,然后测试几种不同底物浓度下的起始速度,即可获得Km和Vmax值。但直接从起始速度对底物浓度的图中确定Km或Vmax值是很困难的,因为曲线接近Vmax时是个渐进过程。因此,通常情况下,我们都是通过米氏方程的双倒数形式来测定,即Lineweaver-Burk plot,也可称为双倒数方程(double-reciprocal plot):

将1/V 对1/[S]作图,即可得到一条直线,该直线在Y轴的截距即为1/Vmax,在X轴上的截距即为1/Km的绝对值。示意图如下:

实验一:米氏常数的测定
篇四:origin拟合米氏方程

双倒数法测定过氧化物酶的米氏常数

学院/专业/班级____________________________________________ 姓名_______________ 合作者___________________________________________________ 教师评定___________

【实验目的】以过氧化物酶为例,掌握测定酶促反应初速率和米氏常数的原理及方法

【实验原理】1913年,Michaelis和Menten运用酶反应过程中形成中间络合物的原理,首先提出了底物浓度和酶促反应速率的关系式,即著名的米氏方程:

vVmaxS 式中:v为反应初速率(微摩尔浓度变化/min);Vmax为最大反应速率(微摩KmS尔浓度变化/min);S为底物浓度(mol/L);Km为米氏常数(mol/L)。这个方程式表明当已知Km及Vmax时,酶反应速率与底物浓度之间的定量关系。Km值等于酶促反应速率达到最大反应速率一半时所对应的底物浓度,是酶的特征常数之一。不同酶的Km值不同,同一种酶与不同底物反应Km值也不同,Km值可以近似的反应酶与底物的亲和力大小:Km越大表明亲和力越小;Km越小表明亲和力越大。大多数纯酶的Km值在0.01100 mmol/L。通过米氏方程的不同变形,可有多种求算米氏常数的方法,一般较常用的双倒数法,即取米氏方程的倒数式:1Km111111以对作图得一直线,该直线与横轴截距。 vVmaxSVmaxSKmvS过氧化物酶是一种对氢受体(H2O2) 底物有特异性,对氢供体底物缺乏特异性的酶,它可催化过氧化氢氧化许多多元酚或多元胺类底物发生显色、荧光或化学发光反应,可用于微量过氧化氢含量测定,也可以和其它酶反应系统偶联可用于测定许多与生命相关的物质:如葡萄糖、半乳糖、氨基酸、尿酸及胆甾醇等,亦是免疫分子和核酸分析中常用的标记物。通常使用的过氧化物酶是从植物辣根中提取的,因此也称为辣根过氧化物酶(horseradish

peroxidase, HRP)。HRP属于含血红素蛋白的一种,是由辅基——氯化血红素(铁卟啉)和脱辅基蛋白(糖蛋白)组成,分子量为44000。

HRP是双底物酶(过氧化氢+多元酚或胺类底物),为求其对某一底物的Km,通常的做法是令另一底物的浓度相对于待测底物大大过量,即可把该酶促反应当作单底物反应来处理。本实验我们选用3,3’,5,5’-四甲基联苯胺(TMB)作为氢受体,它可被Hb催化过氧化氢氧化生成有色产物,该产物在反应条件下(pH5-7左右)为蓝色物质(max=650 nm)。实验中我们使TMB的浓度大过量,测定HRP对H2O2的Km值(反之亦可测定HRP对TMB的Km值)。

【实验仪器及试剂】

仪器:日立 UV-3010紫外可见分光光度计;石英比色皿(1 cm):2只;100 L微量取样器1支(枪头若干);1 mL取液器一支;电磁搅拌器1台(1 cm聚四氟乙烯搅拌子1个 )

试剂:过氧化物酶(HRP溶液: mol/L;3,3’,5,5’-四甲基联苯胺溶液(TMB): mol/L(DMSO溶液);H2O2溶液: mol/L;磷酸缓冲液(PBS):pH= ; mol/L

【实验步骤】

在1 cm的比色皿(内置搅拌子)中加入1.7 mL PBS,然后在搅拌下,依次加入100 L HRP、TMB和不同量的H2O2溶液,马上移入样品架,记录650 nm处吸收峰强度随时间变化的曲线。(参比:1.7 mL PBS+100 L HRP+100 L TMB)

【数据记录与处理】

温度:______

【注意事项】 H2O2应该配置成不同浓度,加入相同体积为佳,但是由于动力学测定本身误差较大,且H2O2本身体积所占比例不大,故采取上述步骤。

【思考题】

1. 可查阅天然的过氧化物酶对H2O2的Km并与测定值进行比较

2. 初速率的测定应注意什么问题?本实验中初速率的单位为A(吸光度)/s(秒)与米氏方程中的单位并不相同,为什么不影响km的测定?如需测定Vmax,应如何进行?

本文来源:http://www.myl5520.com/jiaoanxiazai/124994.html

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